納稅人開具電子專票后，發生銷貨退回、開票有誤、應稅服務中止、銷售折讓等情形，可以開具紅字電子專票。相較于紅字紙質專票開具流程，納稅人在開具紅字電子專票時，無需追回已經開具的藍字電子專票，具有簡便易行好操作的優點。具體來說，開具紅字電子專票的流程主要可以分為三個步驟。

　　第一步是購買方或銷售方納稅人在增值稅發票管理系統（以下簡稱“發票管理系統”）中填開《開具紅字增值稅專用發票信息表》（以下簡稱《信息表》）。根據購買方是否已將電子專票用于申報抵扣，開具《信息表》的方式分為兩類。第一類是購買方開具《信息表》。如果購買方已將電子專票用于申報抵扣，則由購買方在發票管理系統中填開并上傳《信息表》，在這種情況下，《信息表》中不需要填寫相對應的藍字電子專票信息。第二類是銷售方開具《信息表》。如果購買方未將電子專票用于申報抵扣，則由銷售方在發票管理系統中填開并上傳《信息表》，在這種情況下，《信息表》中需要填寫相對應的藍字電子專票信息。

　　第二步是稅務機關信息系統自動校驗。稅務機關通過網絡接收納稅人上傳的《信息表》，系統自動校驗通過后，生成帶有“紅字發票信息表編號”的《信息表》，并將信息同步至納稅人端系統中。

　　第三步是銷售方納稅人開具紅字電子專票。銷售方在發票管理系統中查詢到已經校驗通過的《信息表》后，便可開具紅字電子專票。紅字電子專票應與《信息表》一一對應。

　　需要說明的是，對于購買方已將電子專票用于申報抵扣的情形，因購買方開具《信息表》與銷售方開具紅字電子專票可能存在一定時間差，購買方應當暫依《信息表》所列增值稅稅額從當期進項稅額中轉出，待取得銷售方開具的紅字電子專票后，與《信息表》一并作為記賬憑證。